罗瑛,隋建丽,铁轶,张元平,周平坤,孙志贤.非克隆cDNA文库与RACE技术克隆小剂量辐射诱导新基因RIG1[J].中华放射医学与防护杂志,2001,21(6):407-409
非克隆cDNA文库与RACE技术克隆小剂量辐射诱导新基因RIG1
Cloning of low dose radiation induced gene RIG1 by RACE based on non-cloned cDNA library
投稿时间:2000-09-18  
DOI:
中文关键词:  非克隆cDNA文库  增强RACE  探针杂交  RIG1基因
英文关键词:Non-cloned cDNA library  Enhanced RACE PCR  Probe hybridization  RIG1 gene
基金项目:国家自然科学基金资助项目(39870214)
作者单位
罗瑛 北京放射医学研究所 100850 
隋建丽 北京放射医学研究所 100850 
铁轶 北京放射医学研究所 100850 
张元平 兰州军区总医院临床试验科 
周平坤 北京放射医学研究所 100850 
孙志贤 北京放射医学研究所 100850 
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中文摘要:
      目的 在获得了低剂量辐射诱导新基因RIG1 EST片段的基础上,简便、有效地获得其全长cDNA,进行下一步的基因功能研究。方法 结合应用非克隆cDNA文库技术及增强RACE技术,设计了巢式RACE PCR、生物素磁性分离、生物素标记探针杂交、再次磁性分离的纯化流程。结果 成功地克隆到RIG1 EST片段3'端约1kb的序列,该序列3'端具有明显的polyA加尾信号,有编码区的终止密码子。进一步的分析明确了RIG1 EST的正、负链及其蛋白编码方向,为RIG1 5'端的克隆提供了大量可靠的信息,目前RIG1 5'端的克隆已得到很好的进展。结论 所得结果与我们的设计完全一致,说明这一技术路线是简便可行的,为下一步研究RIG1基因在细胞辐射应激反应中的功能及被辐射诱导表达的调控模式奠定了基础。
英文摘要:
      Objective To obtain full-length cDNA of radiation induced new gene RIG1 based on its ESTfragment. Methods Based on non-cloned cDNA library,enhanced nested RACE-PCR and biotin-avidin labeled probe for magnetic bead purification was used to obtain full-length cDNA of RIG1. Results About 1 kb of 3' end of RIG1 gene was successfully cloned by this set of methods and cloning of RIG1 5' end is proceeding well. Conclusion The result is consistent with the design of experiment.This set of protocol is useful for cloning of fu11-lengh gene based on ESTfragment.
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