中华放射医学与防护杂志  2021, Vol. 41 Issue (2): 155-159   PDF    
机器学习在放射治疗中的临床应用
马泽良1 , 门阔1 , 蒋海行2 , 惠周光3     
1. 国家癌症中心 国家肿瘤临床医学研究中心 中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院放疗科, 北京 100021;
2. 苏州寻正医学科技有限公司研发部, 苏州 215000;
3. 国家癌症中心 国家肿瘤临床医学研究中心 中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院特需医疗部, 北京 100021
[摘要] 放射治疗是癌症的主要治疗手段之一,以机器学习为代表的人工智能飞速发展,可应用于放射治疗临床实践的各个环节,包括临床决策支持、自动勾画靶区、预测疗效和副反应等,提高准确性与效率。尽管面临着结构化数据缺乏、模型可解释性差等挑战,机器学习在放射治疗中的应用将日趋深刻而广泛。本文从机器学习简介、在放射治疗中的临床应用研究进展和挑战与解决之道等3个方面展开综述。
[关键词] 机器学习    人工智能    放射治疗    
Clinical application of machine learning in radiation oncology
Ma Zeliang1 , Men Kuo1 , Jiang Haihang2 , Hui Zhouguang3     
1. Department of Radiation Oncology, National Cancer Center, National Clinical Research Center for Cancer, Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100021, China;
2. Suzhou Xunzheng Medical Technology Co., Ltd. Department of Research and Development, Suzhou 215000, China;
3. Department of VIP Medical Services, National Cancer Center, National Clinical Research Center for Cancer, Cancer Hospital, Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College, Beijing 100021, China
[Abstract] Radiation therapy is one of the main treatment methods for cancer. Machine learning can be used in all aspects of clinical practice in radiation therapy, including clinical decision support, automatic segmentation of target volumes, prediction of treatment efficacy and side effects. Despite the challenges of lacking structured data and poor interpretability of models, the application of machine learning in radiotherapy will become increasingly profound and extensive. This review contains three aspects: introduction of machine learning, the clinical application of machine learning in radiotherapy, challenges and solutions.
[Key words] Machine learning    Artificial intelligence    Radiation oncology    

我国每年新增癌症患者约430万,每年死亡约280万,且呈现逐年攀升的趋势,癌症已成为我国患者的头号死因[1-2]。放射治疗是癌症的主要治疗手段之一,尤其是进入21世纪,放疗技术突飞猛进,其作用越来越重要[3]

放疗的实施过程主要以计算机为载体,数据量大,电子化、结构化程度高,故在人工智能(artificial intelligence,AI)的应用领域有得天独厚的优势。近年来,以机器学习(machine learning,ML)为代表的AI飞速发展[4],让放疗如虎添翼。我国放疗平均发展水平落后,地区间、城乡间放疗水平差异大。ML在放疗领域有着广泛应用,将很好地弥补差距,提升我国放疗整体水平。

一、机器学习简介

ML是AI的一个分支,指的是计算机通过运用数据及统计方法提高系统性能。根据学习数据是否含有标记(label),ML可分为监督学习(supervised learning)、无监督学习(unsupervised learning),以及将两者结合的半监督学习(semi-supervised learning)[5]。ML的代表性算法,包括逻辑回归(logistic regression)、决策树(decision trees)、贝叶斯分类器(Bayesian classifiers)、随机森林(random forest)、神经网络(neural network,NN)、支持向量机(support vector machine,SVM)等,在医学领域常用的是神经网络和支持向量机[6]。神经网络首尾两层分别是输入层和输出层,中间为隐藏层。隐藏层数很多的神经网络,称作“深度神经网络”(deep neural network,DNN)。DNN中最值得关注的是卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)和循环神经网络(recurrent neural network, RNN)。CNN目前在各领域广泛应用,在医学领域的成功应用包括利用照片诊断皮肤癌、利用X射线片筛查乳腺癌、利用影像信息诊断肺炎和眼病等。RNN可深度挖掘和分析医疗文本的信息,将非结构化文本形式的病历数据变成标准化和结构化的数据[7]

二、机器学习在放射治疗中的临床应用现状

ML可应用于放射治疗临床实践的各个环节,包括临床决策支持、自动勾画靶区、预测疗效和副反应等。

1. 临床决策支持系统

(1) 选择治疗方案。Kann等[8]利用CT(computed tomography)影像训练CNN,来判断头颈部鳞癌淋巴结的结外侵犯,CNN判断准确率(area under curve,AUC=0.84)明显优于两名影像专家(AUC=0.70、0.71),有助于更准确地选择治疗方案。刘渊等[9]采用ML判断鼻咽癌淋巴结转移,准确率达86%,有助于放疗靶区的精确勾画。Mattonen等[10]利用CT影像训练ML,检测肺癌立体定向放疗后的复发,以尽早行挽救治疗。利用整个随访过程中的所有影像,ML与医生对复发的判断准确率总体相仿,但对于放疗后6个月内复发的早期预测,ML(错误率24%,假阴性率23%)显著优于医生(错误率35%,假阴性率99%),提示肉眼不易看到的细微的影像学改变,可能是局部复发的早期指标,可以被ML有效利用。Zhou等[11]训练ML能通过增强T1WI影像检测到几乎所有直径≥6 mm的脑转移瘤,并具有较低的假阳性率,有利于尽早行头部立体定向放射治疗。

(2) 选择放疗技术。质子治疗因布拉格峰而具有较好的剂量分布特征,但费用昂贵。Langendijk等[12]采用ML模拟质子治疗的剂量分布,用于预测正常组织并发症概率,以选择适合质子放疗的患者,目前已在荷兰应用于临床。Hall等[13]也做了类似研究,训练ML来预测颅底肿瘤质子放疗危及器官受量,预测受量与实际受量一致性好(皮尔逊相关系数=93%);将预测受量与调强放射治疗的危及器官受量进行比较,预测新患者进行质子放疗是否能够减少危及器官受量,以确定其是否适合质子放疗。

(3) 确定放疗剂量的取舍。Tol等[14]利用由患者放疗计划组成的数据库训练神经网络,来预测新患者能够达到的危及器官受量;Valdes等[15]则更进一步,使用既往放疗计划数据训练ML,除了可以让医生提前判断危及器官的受量,还可以辅助进行相邻器官(如肺和心脏)的剂量取舍。

2. 自动勾画靶区:放疗专家勾画靶区,用时较多,且不同专家勾画的靶区差异明显,影响精确性与一致性。危及器官比肿瘤靶区变异性小,ML更容易实施,故早期研究多集中在自动勾画危及器官。自动勾画主要分为两种,基于图谱的自动勾画(atlas based automatic contouring)和基于深度学习的自动勾画(deep learning based automatic contouring)。

基于图谱的自动勾画出现较早,其原理是预先建立一套或几套危及器官模板,ML自动匹配合适的模板[16]。然而不同患者解剖结构差异大,模板难以覆盖所有情况。准备多套模板可以提高勾画准确度,但计算量大大增加,耗时增多,故要在准确度与速度之间进行平衡。基于深度学习的自动勾画则无需上述折衷,因为其原理是利用CNN进行特征学习,输入越多模板,学习的特征就越准确,所以带来了准确度与速度的双重提升。对于肺、肝、心脏等变异性较小的危及器官,基于深度学习和基于图谱的自动勾画准确度与速度相当;对于食管、脊髓等变异性较大的器官,基于深度学习的自动勾画优势明显[16-17]

在肿瘤靶区勾画方面,Lin等[18]训练三维CNN在MRI(magnetic resonance imaging)影像上勾画鼻咽癌大体肿瘤靶区(gross tumor volume,GTV),与专家勾画的GTV相似度高,Dice相似系数(dice similarity coefficient,DSC)达0.79;医生经过ML辅助,用时减少39.4%,准确度有所提升(DSC, 0.74 vs. 0.78,P < 0.001)。三维CNN不仅利用传统CNN提取的每一层CT图像信息,而且利用层与层之间的信息,信息利用率高,准确度有一定提升。临床肿瘤靶区因为涉及亚临床病灶和临床预防区域,自动勾画相对更难,DNN的表现与专家相比还有差距(DSC, 0.72 vs. 0.79)[19]。近年来研究集中在基于深度学习的靶区自动勾画。

ML在自动勾画靶区领域取得了明显进展,可作为工作流程的一部分,但目前仍需医生审核与修正。进一步发展,ML自动评价靶区勾画质量,不合格者再由医生修正[20]。ML完全取代医生勾画靶区尚需时日。

3. 预测放疗疗效和不良反应:ML利用输入的多个变量来预测放疗疗效和副反应,预测能力明显优于医生。目前研究多基于临床变量和影像,而将两者结合起来的研究较少。早期研究以使用临床变量为主,Klement等[21]使用支持向量机预测早期肺癌立体定向放射治疗后局部失败情况,准确性优于逻辑回归(AUC, 0.79 vs. 0.68)。Oberije等[22]使用ML来预测肺癌患者放疗后生存情况,以及呼吸困难、吞咽困难等不良反应,尽管ML只基于5~7个变量,而医生可以利用患者所有的信息,ML准确度仍优于医生(AUC,0.71 vs. 0.56,P=0.02)。Luo等[23]多种临床变量,包括放疗剂量参数、基因表达情况、细胞因子,训练贝叶斯网络,结果显示单纯使用放疗前的参数AUC为0.78;而使用放疗前后的参数,AUC提高至0.82。

近两年研究集中在利用放射组学特征预测放疗疗效。Lou等[24]使用肺癌放疗前的CT图像训练DNN,预测肺癌局部复发概率,分为高风险和低风险两组,3年累计局部复发率分别为20.3%和5.7%(P < 0.0001)。Li等[25]使用无监督学习将肺癌放疗患者聚类,分为高、中、低风险3组,其中高风险组与低风险组总生存有差别(P=0.041), 提示无监督学习在风险分层方面有着良好的应用前景。Aneja等[26]将影像组学与临床变量结合,预测非小细胞肺癌立体定向放疗后局部控制失败,该研究比较了深度学习、随机森林、支持向量机和逻辑回归的预测能力,结果显示深度学习明显优于其余三者,一致性指数分别为0.81、0.69、0.65、0.59。此外,病理图像因电子化程度较影像低,ML的应用相对较晚,目前利用病理图像预测放疗疗效和副反应的研究较少。Yu等[27]用病理图像训练多种ML算法,将I期非小细胞肺癌患者分为高、低风险两组,两组生存有显著差别(P=0.035)。

ML在放疗临床应用广泛,算法目前已到平台期,改进的余地不大,未来的发展方向是应用更多维度的变量和更庞大的样本量,以提高ML的预测效果。此外,ML在模拟定位图像处理[28]、放疗计划优化[29]、质量控制[30]等方面也有着极其广泛的应用。

三、挑战与解决之道

1.数据缺乏:在医疗领域,ML应用的最大障碍是缺乏足够的结构化数据。面对大数据,深度神经网络准确度明显优于其他机器学习算法;但小样本数据,支持向量机、随机森林等一般会比神经网络准确性高。因此,要根据样本量,开发、选择合适的算法。此外,分布式学习(distributed learning)和迁移学习(transfer learning)也为数据缺乏问题提供了一些解决思路。

患者数据在不同的医院内部很容易获得,但因为隐私、数据安全等问题,医院之间共享数据受到道德、行政、法律等的阻碍[31]。与集中式学习相对应,分布式学习是在数据不离开医院的情况下,从多个医院的数据中学习。Jochems等[32]使用来自5家医疗机构的数据训练贝叶斯网络,预测肺癌放疗后呼吸困难,证实了分布式学习的可行性。分布式机器学习的关键是如何把要处理的大数据或大模型进行切分,在多个机器上做并行训练。Jochems等[33]在另外一项研究中利用分布式学习,使用位于3个国家的3家医院的数据来训练贝叶斯网络,预测肺癌患者的2年生存率,结果显示分布式学习与集中学习效果差异无统计学意义(P=0.26)。

迁移学习是先用任务A的数据训练模型,作为初始化参数用于任务B模型的训练,主要目的是模型重用,即将任务A的模型通过少量的修改应用到任务B[34]。迁移学习在放疗领域已有探索,Zhen等[35]采用基于CNN的迁移学习模型预测宫颈癌放疗引起的直肠并发症;Li等[36]采用迁移学习训练DNN,自动勾画肺癌的内靶区(ITV)。

另外,要转变数据收集的观念,不仅要从现有数据尽可能多地挖掘信息,而且要有计划地产生和采集数据,让数据自动结构化,从源头上解决现有结构化数据不足的问题[37]

2.模型的可解释性:临床判断通常基于人类可以理解的逻辑关系,但DNN是个“黑箱”模型,它将输入变量与输出变量连接起来,其内部规律却难以得知。一般来说,更准确的模型,例如随机森林和神经网络通常是不可理解的;而可理解的模型,例如逻辑回归、贝叶斯网络和决策树,则准确性明显下降,所以需要在准确性和可解释性之间折衷。Caruana等[38]使用ML评估肺炎患者严重程度,ML认为合并哮喘的肺炎患者危险度较低,这与临床经验不符。事后分析,是合并哮喘的肺炎患者会直接转到重症监护病房(ICU),经过积极治疗后,其预后优于普通肺炎,而不是其危险度低。发展可解释性模型是一个解决办法。Valdes等[39]改良了决策树,在13个医疗数据集上测试结果,在保证可解释性的前提下,其准确性与解释性差的ML模型相当,并优于传统的决策树算法。

四、总结与展望

ML可应用于放疗临床的各个环节,包括临床决策支持、自动勾画靶区、预测疗效和副反应等。尽管面临着数据缺乏和模型的解释性等问题,随着技术进步和应用推广,以ML为代表的AI将应用于放疗临床的整个流程,提高效率与准确性,带来放疗领域的变革。凭借稳定而出色的表现,ML将赢得医生和患者的信赖。

利益冲突  无所有作者均声明不存在利益冲突,排名无争议,未因进行该研究而接受任何不正当的职务和财务利益

志谢 本研究还受到苏州高新区科技项目(2017Z001)的资助

作者贡献声明  马泽良负责文献调研、整理文献和论文撰写;门阔、蒋海行负责论文修改;惠周光负责整体论文指导及修改

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